商品有机肥更有优势。这是因为： 首先，商品有机肥比粪肥“无害”。 两种肥料的区别重点在于“腐熟”和“无害”。与商品有机肥相比，粪肥存在许多缺陷：一是含盐分较多，容易使土壤盐化。二是粪肥带有大量的病菌、虫卵，最易引发棚室内的病虫害；三是粪肥养分含量不稳定，不能做到合理补肥。四是粪肥内若含有害物质、重金属物质时，仅凭借高温发酵不能去除。而商品有机肥具有洁净性和完熟性两大特点。商品有机肥在制作过程中不仅进行高温杀菌杀虫，通过微生物完全发酵，并且很好地控制氧气和发酵温度，使有机物质充分分解成为直接形成团粒结构的腐殖质等，同时产生的氨基酸和有益代谢产物得以保留。使用后不会产生对蔬菜有影响的物质。 再次，商品有机肥的养分配比更合理。 商品有机肥中的各类养分是可调整的，可以针对不同的土壤状况使用不同养分含量的产品。