多种抗生素及磺胺类药物对本病均有一定的防治效果。但由于鸭疫巴氏杆菌易产生抗药性，用药前最好能做药敏实验，筛选高敏药物，并注意药物的交替使用。一般可选用下列药物：庆大霉素按4000～8000U/kg体重肌注，每天1～2次，连用2～3d；利高霉素按药物有效成分0.044%拌料口服3～5d；复方敌菌净0.04%比例拌料口服4～6d；磺胺喹沙啉，按0.1%～0.2%比例拌料口服3d，停药2d后再喂3d；青霉素、链霉素肌注，雏鸭各0.5～1万U，中幼鸭各4～8万U。可以疫苗接种免疫。