座壳孢菌通常对柑橘是有益的，而非有害。它是柑橘粉虱和柑橘黑刺粉虱等害虫的重要寄生菌。 座壳孢菌能够寄生在粉虱的若虫和蛹上，从而抑制粉虱的生长和繁殖，在一定程度上对柑橘起到保护作用，减少粉虱对柑橘叶片、果实等造成的危害，比如避免粉虱刺吸汁液导致叶片发黄、生长不良等情况。