橙子果实偏小且果皮粗糙可能由缺硼或螨类危害引起，螨类害虫（如柑橘红蜘蛛）会刺激果皮异常增厚，导致果实畸形、果皮粗糙，但通常不会出现缺硼时的凹陷或木栓化斑点。