杏鲍菇菌瓶的搔菌通常使用搔菌机或手工工具（如刀片、竹签、扁平小铲等），在瓶口中央留下圆形部分，除去其他部分的培养料，促进原基在此区域形成发育。在实际操作中，需根据菌瓶内菌丝生长状况调整，以刚好去除表层老化菌皮和菌种块，一不破坏下方正常菌丝为宜。