番鸭（又称瘤头鸭）在养殖过程中易受多种疫病侵袭，尤其以病毒性和细菌性传染病为主。1.主要病毒性疫病‌：鸭瘟（鸭病毒性肠炎）‌，番鸭“花肝病”（番鸭呼肠孤病毒病）‌，‌番鸭细小病毒病（“三周病”）‌，雏番鸭小鹅瘟‌，鸭病毒性肝炎‌‌，禽流感等。2.主要细菌性疫病‌：鸭传染性浆膜炎（鸭疫里默氏杆菌病）‌，鸭大肠杆菌病‌‌，鸭霍乱（禽巴氏杆菌病）‌，沙门氏菌病（鸭副伤寒）‌等。3.其它疫病‌：曲霉菌病，球虫病等。