小麦根腐病较难治疗,应以预防为主,播前用药拌种是预防该病最有效的措施,适用药有咯菌腈、苯醚甲环唑、戊唑醇等。25克/升咯菌腈悬浮种衣剂,用于小麦防治根腐病,每100公斤麦种推荐用制剂150~200毫升进行种子包衣。4%咯菌·噻霉酮悬浮种衣剂,含噻霉酮2.3%、咯菌腈1.7%,用于小麦防治根腐病,每100公斤麦种推荐用制剂125~175克进行种子包衣。
田间发现小麦根腐病病株后,应在发病初期,及时选用丙环唑、烯唑醇等药喷雾防治,喷药应喷匀、喷透,使药液充分浸透根、茎。250克/升丙环唑乳油,小麦喷雾防治根腐病,每亩推荐用制剂33毫升。25%丙环唑乳油,小麦喷雾防治根腐病,每亩推荐用制剂33.2~66克。生产上也可以结合防治纹枯病,在小麦返青拔节期选用丙环唑、烯唑醇等药预防根腐病。